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求助:溶剂条件下优化特戊酸根离子(-OPiv)以及-OBoc虚频无法消除

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发布时间: 2025-6-17 11:51

正文摘要:

sob老师的帖子我已认真地阅读。尝试过的高精度关键词如下: 1. m06/def2svp em=gd3 opt=(calcall, verytight, notrust) freq scrf=(pcm,solvent=generic, read(此处自定义为1,4-dioxane)) int=superfine 2. ...

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leoliu 发表于 Post on 2025-6-19 14:42:13
sobereva 发表于 2025-6-19 07:27
先用B3LYP-D3(BJ)或wB97XD做opt freq,拿无虚频的结构当M06-D3的初猜,结合很小步长上限做opt freq,并且加 ...

谢谢老师,问题这样就解决了
sobereva 发表于 Post on 2025-6-19 07:27:19
先用B3LYP-D3(BJ)或wB97XD做opt freq,拿无虚频的结构当M06-D3的初猜,结合很小步长上限做opt freq,并且加上CPHF=grid=fine。若还有虚频,上传输出文件
wzkchem5 发表于 Post on 2025-6-18 12:48:28
leoliu 发表于 2025-6-18 12:12
老师,这是我orca的输入文件
%maxcore     1000
%pal nprocs   4 end

https://github.com/wzkchem5/CompoundScripts下载最新版的compound script,搭配最新版ORCA(6.1.0版),再试试。
这个compound script的很早的版本是有bug的
leoliu 发表于 Post on 2025-6-18 12:12:05
wzkchem5 发表于 2025-6-17 14:33
试试用ORCA的iterative optimization方法自动消虚频,再把收敛的结构放到高斯里优化

老师,这是我orca的输入文件
%maxcore     1000
%pal nprocs   4 end
* xyz  -1   1
C      1.56420700   -0.07587300   -0.00410300
O      1.54179300    1.16386800    0.00165300
O      0.30723000   -0.74777900   -0.01624100
C     -0.93289400   -0.04703500   -0.00015300
C     -1.11055900    0.81226800   -1.24723800
H     -2.12966000    1.23405800   -1.28038100
H     -0.38345300    1.63353900   -1.26128000
H     -0.96434600    0.19908100   -2.15109000
C     -1.97592100   -1.15705100   -0.00499500
H     -1.85598200   -1.80012500    0.88055000
H     -2.99640700   -0.74056800    0.00119200
H     -1.86121400   -1.78650900   -0.90094300
C     -1.09274300    0.78419700    1.26824500
H     -2.11577100    1.19233300    1.33315300
H     -0.91922400    0.15370800    2.15512100
H     -0.37526600    1.61379300    1.28480500
O      2.51207600   -0.86588300   -0.00187100
*

%compound "iterativeOptimization.cmp"
end

但是报错:
                        Compound Error
Routine        : AbortNonExistingVariable
Line (    62)  : OptDone :
Reason of error: Variable 'OptDone' is not defined before usage. Please define the variable.

Hint: In case the reported input line does not seem to be problematic,
          please check if there is a missing ';' above this line.
我是第一次使用orca,网上也没找到有效的解决办法。
leoliu 发表于 Post on 2025-6-17 14:56:22
wzkchem5 发表于 2025-6-17 14:33
试试用ORCA的iterative optimization方法自动消虚频,再把收敛的结构放到高斯里优化

好的,谢谢老师,我试试。
wzkchem5 发表于 Post on 2025-6-17 14:33:28
leoliu 发表于 2025-6-17 12:24
是有机金属体系,导师参考不久前JACS说用M06D3来算,不然我肯定不用这个

试试用ORCA的iterative optimization方法自动消虚频,再把收敛的结构放到高斯里优化
leoliu 发表于 Post on 2025-6-17 12:24:31
wzkchem5 发表于 2025-6-17 12:14
M06以外的泛函试过吗?
M06、M06-2X对格点都很敏感,格点不是特别大的话很容易出虚频。而且M06对于有机体 ...

是有机金属体系,导师参考不久前JACS说用M06D3来算,不然我肯定不用这个
wzkchem5 发表于 Post on 2025-6-17 12:14:13
M06以外的泛函试过吗?
M06、M06-2X对格点都很敏感,格点不是特别大的话很容易出虚频。而且M06对于有机体系也没有特别的精度优势,不如用B3LYP-D3
leoliu 发表于 Post on 2025-6-17 11:53:20
图上的是OBoc,两个情况很相似。

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