GROMACS能否模拟既有DNA又有RNA的杂链？

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发布时间: 2025-5-22 09:34

我有一个核酸体系，由3条纯RNA链和3条RNA1-DNA1-RNA2-DNA2杂交链通过碱基互补配对形成四面体结构（见下面的图）。在第一步结构转换就出现了报错：命令为，所用力场为 amber14sb_OL15.ff： gmxpdb2gmx -f BIRDS_fo ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-5-22 09:57:58

手动把结构文件里DNA和RNA部分设成不同的链名就完了

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