新版本相对旧版本的变化:https://github.com/iRASPA/RASPA2/blob/master/ChangeLog.md 批量的话 可以用ASE来读取CIF文件 试试然后用这个接口https://github.com/Quantum-Accelerators/raspa_ase 在ASE里跑RASPA2 |
xyan11 发表于 2025-4-24 12:26 是这样啊!非常感谢!我初学,也没有代码基础,用自己小破轻薄本跑,运行很久都没结束,以为没跑通。 新版的RASPA2有什么区别呢 还想请问一下就是,我拿到一批cif文件的话,该怎么批量准备input、pseudo atoms和力场相关的两个def文件呢。 |
本帖最后由 xyan11 于 2025-4-24 12:30 编辑 这个是正常的输出信息 simulation.input里第7行"WriteBinaryRestartFileEvery 1000" 这个就是命令每1000步写一个模拟存档点 万一模拟因为不可抗力退出了 你可以读取这个存档文件来继续跑模拟 Writing Crash-file! 后面的数字0-4000再到0是对应第三行"NumberOfInitializationCycles 5000"的5000个初始化步 后面从0-15000是采数据的15000步 对应第二行"NumberOfCycles 15000" 顺便多个嘴,你用的RASPA2版本似乎是numat的(https://github.com/numat/RASPA2) 有点老 很多年没有维护。 建议你用iRASPA的这个版本(https://github.com/iraspa/RASPA2)稍微新一点。 或者你有N卡GPU的话 可以试试gRASPA(https://github.com/snurr-group/gRASPA) 前一阵子发了JCTC(10.1021/acs.jctc.4c01058) 据说跑起来特别快 希望有所帮助 |
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