如何从生产模拟步产生的轨迹文件中提取xyz速度文件?

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发布时间: 2025-4-17 09:48

如何利用gromacs生成的trr轨迹文件提取出蛋白片段中所有原子的速度，输出xyz格式的速度文件呢？如图所示，在生产模拟的预准备阶段设置了输出速度，并且trr轨迹文件中包含速度，但是运用 gmx dump -f your_trajecto ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-4-17 15:15:27

如果你没用nstvout在trr里写入速度信息就没法提取

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