计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

求助material studio如何给导出的结构文件添加原子编号

查看数: 436 | 评论数: 4 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2025-4-15 22:07

正文摘要:

本帖最后由 风沙 于 2025-4-16 09:09 编辑 求助各位老师,我用的是material studio 2020。 1.我从pubchem数据库下载了紫杉醇二维结构的sdf文件,通过material studio将紫杉醇的二维结构转化成三维结构,并导出pd ...

回复 Reply

风沙 发表于 Post on 2025-4-16 14:14:44
日月崇光 发表于 2025-4-16 13:56
2.当你用高斯做完结构优化生成的out文件再转换成pdb或mol2就会有编号了

我需要建一条聚合度是1532的高聚物链,原子数太多了,所以没用高斯优化,就直接用ms建的模,然后导出结构文件的
风沙 发表于 Post on 2025-4-16 14:12:40

好的,谢谢
日月崇光 发表于 Post on 2025-4-16 13:56:37
2.当你用高斯做完结构优化生成的out文件再转换成pdb或mol2就会有编号了
mol 发表于 Post on 2025-4-16 08:59:39
3是不影响的

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-16 04:36 , Processed in 0.452336 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list