Lance先生 发表于 2025-3-26 22:37
为什么不做NVT看这个。

谢谢大佬指导。我在这段时间还自己查找了资料，该问题已解决。

为什么不做NVT看这个。出处：北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/KGMX）

1. 检查top中位置限制放哪，其实搜一搜那报错就可以找到解决方法。
2. 不是不能跑NVT，而是没有必要。

Lance先生 发表于 2025-3-26 22:07
你这模型好像是不用跑NVT系综。

我的项目是用分子动力学模拟，探究猪胰腺源α-淀粉酶（PPA）与8个糖单元的多糖小分子配体的相互作用机制。如果不用NVT系综的话能请教一下原因吗？

你这模型好像是不用跑NVT系综。