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TDDFT-ris 2.0 更新，200原子体系无压力, 支持Multiwfn

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本主题由 sobereva 于 2024-12-25 07:34 加入精华

JohnCase

发布时间: 2024-12-24 21:35

正文摘要:

本帖最后由 JohnCase 于 2025-1-15 15:56 编辑 ris方法原文：Zhou, Zehao, Fabio Della Sala, and Shane M. Parker. Minimal ...

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njust-lbc 发表于 Post on yesterday 17:37

JohnCase 发表于 2025-8-21 13:05
export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:$(pwd)
先在执行python的目录里执行这个命令试试？这个问题在mokit里正 ...

好的，感谢！我试一下。

JohnCase 发表于 Post on yesterday 13:05

njust-lbc 发表于 2025-8-21 11:17
是用conda安装的。激活后还是不行：(

export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:$(pwd)
先在执行python的目录里执行这个命令试试？这个问题在mokit里正在被修复

njust-lbc 发表于 Post on yesterday 11:17

本帖最后由 njust-lbc 于 2025-8-21 11:19 编辑

JohnCase 发表于 2025-8-21 11:01
你是如何安装mokit的呢？如果是conda安装，那么需要conda activate激活这个环境后再运行

是用conda安装的。激活后还是不行：(

屏幕截图 2025-08-21 111721.jpg (307.79 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

JohnCase 发表于 Post on yesterday 11:01

njust-lbc 发表于 2025-8-20 19:56
您好，请问运行该程序到最后一步出现这种报错是什么原因呢？

你是如何安装mokit的呢？如果是conda安装，那么需要conda activate激活这个环境后再运行

njust-lbc 发表于 Post on 前天 19:56

本帖最后由 njust-lbc 于 2025-8-20 22:26 编辑

JohnCase 发表于 2024-12-28 01:32
现在支持ECD了

您好，请问运行该程序到最后一步出现这种报错是什么原因呢？

屏幕截图 2025-08-20 222556.png (29.39 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

JohnCase 发表于 Post on 2024-12-28 01:32:27

smooth85 发表于 2024-12-26 08:56
按照了流程测试了一下，代码很好用，计算速度很快。感谢作者的付出~

有两个问题：

现在支持ECD了

smooth85 发表于 Post on 2024-12-26 09:50:38

感谢回复，期待更新

JohnCase 发表于 Post on 2024-12-26 09:44:21

smooth85 发表于 2024-12-26 08:56
按照了流程测试了一下，代码很好用，计算速度很快。感谢作者的付出~

有两个问题：

我自己测试2-4核以后可能就没有更多收获了，毕竟主要部分是numpy计算。
可以做ECD，但是相关的benchmark工作还没有，精度是不确定的。
TDA代码其实是有的，只是这次改进的时候这部分代码没翻新。。。如果只是看激发光谱的话TDDFT比TDA的振子强度要好不少。我可能元旦以后才有空把TDA这部分也优化一下~

smooth85 发表于 Post on 2024-12-26 08:56:06

按照了流程测试了一下，代码很好用，计算速度很快。感谢作者的付出~

有两个问题：
1. 虽然设置了MKL_NUM_THREADS 和 OMP_NUM_THREADS，但是CPU依然只用了不到一半在跑。

2. 是否能做ECD ？

另外，期待TDA代码的加入

再次感谢开发者~

yzh 发表于 Post on 2024-12-25 08:53:43

JohnCase 发表于 2024-12-24 23:01
荧光吗？目前还没有开发梯度，因此没有这个功能（以后有空再做

谢谢，期待老师的荧光

JohnCase 发表于 Post on 2024-12-25 00:53:36

wzkchem5 发表于 2024-12-25 00:42
对于足够大的体系应该还是O(N^4)标度吧，因为RI-K是O(N^4)的scaling？有没有考虑用domain fitting之类的手 ...

我有空去瞅瞅domain fitting。

JohnCase 发表于 Post on 2024-12-25 00:49:51

本帖最后由 JohnCase 于 2024-12-25 01:24 编辑

wzkchem5 发表于 2024-12-25 00:42
对于足够大的体系应该还是O(N^4)标度吧，因为RI-K是O(N^4)的scaling？有没有考虑用domain fitting之类的手 ...

确实，我看了下详细的时间，即便截断了虚轨道，RIK也还是比RIJ更贵。

wzkchem5 发表于 Post on 2024-12-25 00:42:14

对于足够大的体系应该还是O(N^4)标度吧，因为RI-K是O(N^4)的scaling？有没有考虑用domain fitting之类的手段降低scaling？

JohnCase 发表于 Post on 2024-12-24 23:01:59

yzh 发表于 2024-12-24 22:45
请问老师发射光谱（PL）的结果怎么样，对比性如何？谢谢

荧光吗？目前还没有开发梯度，因此没有这个功能（以后有空再做

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