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grompp提示atomtype not found

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发布时间: 2024-11-28 10:09

正文摘要:

求助各位大佬,我做的前药自组装,拓扑参数都是sobtop基于Amber,GAFF生成的, gmx grompp提示

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z1065480896 发表于 Post on 2025-3-28 17:45:50
milk_q 发表于 2024-11-28 19:26
已解决谢谢sob老师

请问直接是定义include在top文件中莫
milk_q 发表于 Post on 2024-11-28 19:26:15
sobereva 发表于 2024-11-28 17:44
引用AMBER力场目录下的ffnonbonded.itp得到对水的原子类型的定义

已解决谢谢sob老师
sobereva 发表于 Post on 2024-11-28 17:44:16
引用AMBER力场目录下的ffnonbonded.itp得到对水的原子类型的定义
pal 发表于 Post on 2024-11-28 16:19:38
报错信息里面写了,没有水的原子类型OW_spc

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