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在模拟电极电解液界面时,出现了电解液从Z方向进入到电极的另一侧的情况该如何避免?

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发布时间: 2024-11-26 20:02

正文摘要:

各位大佬好,本人刚开始学习GROMACS有许多不明白的地方想请教一下大家。首先我在模拟电极电解液界面的时候,跑完eq发现有部分电解液从Z方向进入到了电极下表面,请问这种情况该怎么避免呢?我想让下方只有电极存 ...

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hanyu123 发表于 Post on 2025-3-27 16:37:16
mol 发表于 2025-3-1 14:50
用NVT系综即可,上面加个真空层。

感谢老师您的回答
mol 发表于 Post on 2025-3-1 14:50:45
用NVT系综即可,上面加个真空层。
hanyu123 发表于 Post on 2024-11-27 19:38:48
sobereva 发表于 2024-11-27 15:41
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必 ...

好的,多谢卢老师指导,我也一并再细读置顶帖。
sobereva 发表于 Post on 2024-11-27 15:41:19
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

用wall就完了。几句话说不清楚,北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/KGMX)里有具体例子可以参考

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