求助平衡系统时，盒子逐渐变大，溶剂和蛋白分开

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发布时间: 2024-11-7 09:33

本帖最后由 watermelon_ 于 2024-11-7 13:57 编辑最小化和加热系统后，进行npt时，盒子开始逐渐变大，出现大量空隙，溶剂和蛋白分割成体积和间隔相似大小的团块报错内容是 ERROR: Calculation halted. ...

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davide1988 发表于 Post on 2025-4-3 21:15:12

这个问题应该是cuda版本不合适，试着改变一下cuda版本

参与人数 Participants 1	eV +5	收起理由 Reason
watermelon_	+ 5	正解

watermelon_ 发表于 Post on 2025-3-7 20:01:48

hongyanyin 发表于 2025-2-19 11:28
您好，请问该问题解决了吗？我使用在集群上使用AMBER24也遇到了同样的问题

没有哪后来改学NAMD了

davide1988 发表于 Post on 2025-2-25 19:34:44

我也遇到了类似的问题，用30系列卡跑就正常，用40系列跑体系就会散开

参与人数 Participants 1	eV +2	收起理由 Reason
watermelon_	+ 2	谢谢

hongyanyin 发表于 Post on 2025-2-19 11:28:34

您好，请问该问题解决了吗？我使用在集群上使用AMBER24也遇到了同样的问题

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