计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

经验分享:Windows Server 2016下Gromacs 2024.3 GPU版本编译经历

查看数: 2243 | 评论数: 7 | 收藏 Add to favorites 7
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2024-9-16 22:00

正文摘要:

本帖最后由 JinxrDK 于 2024-9-16 22:00 编辑 近日,课题组分配了一台Windows Server 2016系统的服务器,配备了一片A100,考虑到切换Linux系统影响其他同门工作,出于好奇,便尝试在本系统下编译GPU版本的Gromacs ...

回复 Reply

JinxrDK 发表于 Post on 2025-2-11 16:46:55
bard_skd 发表于 2025-2-11 01:04
大佬请教一下,我编译多次,也一直报错,不得已只能尝试使用另一位老哥编译好的2023.2版本,和你的对比了一 ...

应该是他编译的设置的是-DGMX_SIMD=AVX2_128,指令集间的具体差异我不了解。你可以用我编译好的和你的版本对比测试下性能。
bard_skd 发表于 Post on 2025-2-11 01:04:30
大佬请教一下,我编译多次,也一直报错,不得已只能尝试使用另一位老哥编译好的2023.2版本,和你的对比了一下,有一处不同:
我的显示是SIMD instructions:  AVX2_128(你的截图里是256),请问有无影响啊
orangehavedream 发表于 Post on 2024-12-28 14:53:01
本帖最后由 orangehavedream 于 2024-12-28 21:14 编辑

太牛了!我一周还是没弄好,感谢楼主给了一个编译好的版本
----------------------------------
我使用的是CUDA 12.6,cmake 2.9,VS2022 ,gromacs2024.4。按照本帖解决方法改了很多地方,尝试了6-7遍总是报错NVCC/C -broken
之后,我把所有的软件都删掉,按照楼主的发的配置重新进行了一下,一遍就成功了!太感谢了!!!
JinxrDK 发表于 Post on 2024-11-25 16:03:08
Huschein 发表于 2024-10-26 19:52
强的,当时搞这个折腾了我一个星期

我也搞了三天,参考资料实在是难找
JinxrDK 发表于 Post on 2024-11-25 16:02:33
补充:近期发现2.1中问题并非全部源于CMake版本问题,采用CMake 3.27编译时发现Intel Xeon Platinum 8260 CPU下无法编译AVX_512版本,报错同2.1,仅可编译AVX2_256版本
Huschein 发表于 Post on 2024-10-26 19:52:58
强的,当时搞这个折腾了我一个星期
JinxrDK 发表于 Post on 2024-9-16 22:02:20
编译设置: cmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=D:\XXX\SOFTWARE\GROMACS2024 -DGMX_FFT_LIBRARY=fftw3 -DCMAKE_PREFIX_PATH=D:\XXX\PACKAGE\FFTW310 -DGMX_GPU=CUDA  -G "Visual Studio 16 2019" -DCUDA_TOOLKIT_ROOT_DIR="C:/Program Files/NV
IDIA GPU Computing Toolkit/CUDA/v11.8" -DGMX_SIMD=AVX2_256

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-17 19:34 , Processed in 0.183898 second(s), 33 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list