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Ubantu 18.04安装gromacs2021最后一步报错，全过程展示

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znjnancy

发布时间: 2024-9-4 17:05

正文摘要:

各位大佬，我在ubantu上安装gmx，在最后一步编译make install 时报错。下面，我把全部的过程进行展示，请佬们指点迷津。一、安装cmake 3.29 本机上已经有cmake 3.10，但是版本太低了，需要升级为高版本的。（1 ...

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znjnancy 发表于 Post on 2025-3-19 11:23:26

15939474177 发表于 2025-2-22 21:25
我直接按照2018版本的安装方法安装了2019的，发现出现gcc错误

查一查gcc版本是否有问题，错误要截图大家才好解答

znjnancy 发表于 Post on 2025-3-19 11:22:55

15939474177 发表于 2025-2-22 15:34
在bashrc环境中改成新的gmx版本的路径，这个过程有些问题想向您请教一下可以吗？大佬可以留下联系方式吗

直接评论呀，看到都会解答的

15939474177 发表于 Post on 2025-2-22 21:25:20

snljty2 发表于 2025-2-22 19:52
Environment Module了解一下。

我直接按照2018版本的安装方法安装了2019的，发现出现gcc错误

snljty2 发表于 Post on 2025-2-22 19:52:49

15939474177 发表于 2024-10-20 12:15
大佬，想问下就是原本是2018版本的，若是安装2019版本，需要把原来2018版本的卸载吗？还是说直接安装2019 ...

Environment Module了解一下。

15939474177 发表于 Post on 2025-2-22 15:34:41

在bashrc环境中改成新的gmx版本的路径，这个过程有些问题想向您请教一下可以吗？大佬可以留下联系方式吗

znjnancy 发表于 Post on 2024-10-29 18:14:26

15939474177 发表于 2024-10-20 12:15
大佬，想问下就是原本是2018版本的，若是安装2019版本，需要把原来2018版本的卸载吗？还是说直接安装2019 ...

不用卸载2018的，只需要在bashrc环境中改成新的gmx版本的路径就行了

15939474177 发表于 Post on 2024-10-20 12:15:56

znjnancy 发表于 2024-9-4 20:10
安装成功了，喜极而泣

重新安装gmx

大佬，想问下就是原本是2018版本的，若是安装2019版本，需要把原来2018版本的卸载吗？还是说直接安装2019的版本呢

znjnancy 发表于 Post on 2024-9-4 20:10:38

安装成功了，喜极而泣

重新安装gmx
解压后进入目录
cd gromacs-2021
mkdir build
cd build
export CMAKE_PREFIX_PATH=/实际路径/fftw338
cmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/实际路径/gmx2021 -DCMAKE_C_COMPILER=/usr/bin/gcc -DCMAKE_CXX_COMPILER=/usr/bin/g++
make install -j
在bashrc中添加：source /实际路径/gmx2021/bin/GMXRC

去gromacs上官网上参考了安装的教程后解决的https://manual.gromacs.org/docum ... index.html#compiler

t675210552 发表于 Post on 2024-9-4 17:17:59

可能是你gcc g++版本与此版本gromacs不相匹配

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