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Gromacs常用命令分享

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发布时间: 2024-5-22 22:43

正文摘要:

整理了一些gmx常用命令,比较具有个人色彩,但是是通用的。 可以以此为基础,根据自己的实际需要建立属于自己命令库。 需要自取。

回复 Reply

Cribug 发表于 Post on 2025-4-14 13:01:57
xliu97 发表于 2025-3-22 00:57
感谢分享。另外借楼我想请教一下,我使用gmx trjconv命令得到的gro文件结合VMD查看我的胶束体系,但是里面的 ...

建议您在这个网页详细学习一下https://manual.gromacs.org/current/onlinehelp/gmx-trjconv.html
xliu97 发表于 Post on 2025-3-22 00:57:49
感谢分享。另外借楼我想请教一下,我使用gmx trjconv命令得到的gro文件结合VMD查看我的胶束体系,但是里面的胶束被盒子切开不完整,-pbc mol/-pbc cluster/-pbc nojump这几个命令的区别是什么?
gaotianliang 发表于 Post on 2024-7-12 21:00:54
感谢分享
xptracy 发表于 Post on 2024-6-11 14:03:37
感谢分享
Cribug 发表于 Post on 2024-6-11 13:23:41
emmmmm 发表于 2024-6-1 10:27
你好,我想问一下windows系统下 gromacs调用脚本的命令有吗

这个我不太了解,应该是有用的吧
emmmmm 发表于 Post on 2024-6-1 10:27:20
你好,我想问一下windows系统下 gromacs调用脚本的命令有吗

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