BOMD轨迹的模拟问题

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发布时间: 2016-12-1 13:10

如图所示，作者介绍是通过BOMD模拟得到的轨迹图，不同颜色表示不同的原子，通过跨度范围的大小阐述原子的振动或转动的幅度大小。我的问题是，1、这是一个三维的分子结构，坐标轴中的中的参数的意思是确定一个平面 ...

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0916 发表于 Post on 2016-12-1 16:47:13

sobereva 发表于 2016-12-1 14:30
横纵坐标就是分子的两个内坐标，把轨迹当中每一帧的这俩内坐标数值记录下来，然后导入origin，对这两列绘制 ...

谢谢老师，明白啦

sobereva 发表于 Post on 2016-12-1 14:30:08

横纵坐标就是分子的两个内坐标，把轨迹当中每一帧的这俩内坐标数值记录下来，然后导入origin，对这两列绘制折线图即可

ADMP可以
ADMP与BOMD原理上不等价，支持的关键词也不同，但可以实现相同的目的

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