wzkchem5 发表于 2024-2-10 17:16 您好,感谢您的回答。我用了PCM的水溶剂模型;由于之前未了解构象搜索这一块内容,因此未进行构象搜索,后续我再看看相关的知识,谢谢您 |
1239514831 发表于 2024-2-9 01:28 还是应该计算一下溶剂配位的Gibbs自由能变,如果发现确实容易配上一个溶剂,那么计算的时候还是要加溶剂。文献没加溶剂分子可能是因为文献不加溶剂分子也碰巧算出了和实验吻合的结果,而审稿人又没有细究溶剂的问题。 另外你加了隐式溶剂模型了吗?做了构象搜索了吗? |
dnlx 发表于 2024-2-9 01:25 谢谢您的回答,但我感觉用溶剂配上应该不影响? 我看文献在没有具体单晶结构的时候也是直接用3配位来进行计算的。 参考文献:doi:10.1016/j.aca.2022.339543 doi:10.1016/j.snb.2021.130241 |
本帖最后由 dnlx 于 2024-2-9 02:18 编辑 铜离子应该是四或六配位的,剩下的配体应该用溶剂补上? |
我也遇到过这种问题 最终也没有解决 感觉可能是结合位点不太对 |
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