高斯-xtb联用计算IRC坐标变化不连续，求助原因

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发布时间: 2024-1-16 23:51

本帖最后由 lpy-lzu 于 2024-1-17 00:09 编辑我按照《将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)》帖子里的教程对一个过 ...

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王二葛 发表于 Post on 2024-1-17 12:13:31

我遇到了 GauIRC2xyz 中 TS 这一帧坐标不连续的情况，但没检查问题出在哪里

如果只是为了解决不连续，可用 VMD 中 RMSD trajectory > align

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