wzkchem5 发表于 2024-1-8 18:10  受教啦，所以不要用双杂化算gap |
不想飞的猫头鹰 发表于 2024-1-8 10:58 不是，是因为双杂化泛函的PT2部分只影响能量而不影响轨道，但是去掉PT2的那部分泛函又不准，因为动态相关不足。所以PWPB95虽然能算gap、轨道，但是第一这个gap/轨道不宜叫做PWPB95的gap/轨道（因为是PWPB95去掉PT2部分算出来的），第二这个gap/轨道很可能还不如普通杂化泛函靠谱 |
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wzkchem5 发表于 2024-1-8 17:12 嗯嗯，再次感谢 |
hebrewsnabla 发表于 2024-1-8 16:10 嗯嗯，谢啦。PWPB95不能算gap是因为这方法只能求出占据轨道吗 |
不想飞的猫头鹰 发表于 2024-1-8 05:58 所以和实验方面对接的时候，不仅要说结果是多少，还要说这个泛函的一般误差范围是多少，并用相关benchmark文章作支持。乃至于帮他们分析实验过程本身，帮他们发现实验哪里可能做得或者解读得有问题 |
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本帖最后由 hebrewsnabla 于 2024-1-8 16:14 编辑 不想飞的猫头鹰 发表于 2024-1-7 20:11 多聚体的话，有个结合能是可观测量，所以做测试集的意义比较大。单体的话就没有这个量，但是单体的频率、极化率、激发能等性质是可以观测的，所以单分子的测试集多得很，大概只是没有你感兴趣的。至于你关心的HOMO-LUMO gap、布居分析结果、键级都是不可观测量，基本不可能找到相关的测试集。 直接拿wB97MV算就完了，别benchmark了。 顺便，PWPB95是无法计算HOMO-LUMO gap的。 |
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本帖最后由 不想飞的猫头鹰 于 2024-1-8 13:01 编辑 七尺贱 发表于 2024-1-8 09:58 嗯嗯，我想趁着这次帮忙顺便积累点benchmark的知识经验，一般hf成分高的算的gap会比较大，如果凑实验的话，不断换泛函总能找到对应差不多的  不过这也算是我们搞理论的悲哀了，不少实验组自己提出来机理猜想，然后让理论组验证，验证不出来就让反复换理论方法去凑他们的猜想，也不去检查实验过程或者怀疑自己的猜想有问题，把我们当成P图的了 |
本帖最后由 七尺贱 于 2024-1-8 10:02 编辑 不想飞的猫头鹰 发表于 2024-1-8 05:43 游客，本帖隐藏的内容需要积分高于 25 才可浏览，您当前积分为 0 。我个人觉得你无需这么麻烦，不是你自己文章，算出一个正确合理的结果就好，benchmark是一个非常非常麻烦谨慎的事情 |
本帖最后由 不想飞的猫头鹰 于 2024-1-8 05:54 编辑 wzkchem5 发表于 2024-1-8 00:40 嗯嗯，感谢。还想了解下，为什么测试泛函一般都是用弱相互作用多聚体体系来测而很少用单分子来测？（可能有，但是我目前找的文献基本都是二聚体多聚体体系）可不可以推荐些比较大的单分子的测试集呢？如果构建单分子测试集的话，可不可以自己从弱相互作用测试集里找比较大的体系，然后自己设计一些类似的体系，用另外的合适的泛函（估计用泛函是优化不动的）或者半经验方法进行优化，拿这些优化后的结构作为其他泛函的测试对象？之前也想过，如果直接从弱相互作用的较大二聚体中抠出来单分子，由于没有了配对的对象，结构肯定还得做重新优化，不如直接找单分子测试集更合理。 |
不想飞的猫头鹰 发表于 2024-1-7 13:11 wB97M-V的计算量不比其他杂化泛函大多少，所以如果你本来就打算用杂化泛函，而且在测试之前只信任wB97M-V的话，那就应该直接拿wB97M-V做实际计算，而不是以wB97M-V为基准挑一个其他泛函再拿这个泛函算。 |
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本帖最后由 不想飞的猫头鹰 于 2024-1-7 20:37 编辑 wzkchem5 发表于 2024-1-7 19:32 嗯嗯，感谢您的热心回复，pwpb95和wb97m-v在很多问题上都表现很好，能不能以这两个为标准，看其他的相对于它俩的偏差来衡量呢？做这样的比较，开RI会影响结论的一致性吗？ 不太清楚为什么单分子测试集和文章比较少，目前看到的基本全都是多聚体的体系。 |
| 这种测试的问题在于，HOMO-LUMO gap、布居分析结果、键级等都是实验不可观测量，尤其后两者的定义本身就有很大任意性，你用不同泛函算完以后，以什么作为基准来确认哪个泛函更好呢？这也是为什么文献没人做这种benchmark。所以我觉得按通常的选泛函的方法就行了，不需要做新的benchmark。 |
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