利用软势修正低精度大型蛋白模型的原子重叠问题一例

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发布时间: 2024-1-2 00:19

本帖最后由 Graphite 于 2024-1-2 11:21 编辑利用软势修正低精度大型蛋白模型的原子重叠问题一例石墨首发计算化学公社在预处理一些大型、柔性模型时，会遇到表现为”bad contact”、”inf( ...

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Graphite 发表于 Post on 2025-7-28 13:19:28

Sync 发表于 2025-7-28 11:53
我用gromacs的软心势跑高分子体系（类似于文中的4的用法），跑完之后想切换到正常的力场再跑模拟，结果遇到 ...

那个形式和用途上和这个cosine函数不是一回事

Sync 发表于 Post on 2025-7-28 11:53:28

我用gromacs的软心势跑高分子体系（类似于文中的4的用法），跑完之后想切换到正常的力场再跑模拟，结果遇到这个原子重叠的情况

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