npt平衡预处理时报错：Group and protein referenced in the .mdp file was not fo...

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发布时间: 2023-10-29 21:33

本帖最后由 sljm 于 2023-10-29 21:55 编辑运行命令： gmx grompp -f npt.mdp -cnvt.gro -r nvt.gro -t nvt.cpt -p topol.top –n index.ndx -o npt.tpr –maxwarn 1 时报错 G ...

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芝士奶盖四季春 发表于 Post on 4 day ago

LimEngZ 发表于 2024-4-22 08:18
补充一下，我也遇见一样问题，我在排查mdp里名称正确后仍报错，添加 -n index.ndx 指定索引文件最终解决

...

您好，我是新手也是遇到了这个问题，可以详细说一下你的解决方法吗？

LimEngZ 发表于 Post on 2024-4-22 08:18:25

本帖最后由 LimEngZ 于 2024-4-22 08:19 编辑

补充一下，我也遇见一样问题，我在排查mdp里名称正确后仍报错，添加 -n index.ndx 指定索引文件最终解决

sobereva 发表于 Post on 2023-10-30 02:12:28

体系没有蛋白质当然不能用Protein、Non-Protein这样对含蛋白质的体系才默认就有的组名

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