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用acpype搭配gromacs，添加离子报错

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jia1012428

发布时间: 2023-2-12 04:04

正文摘要:

按照Protein-Ligand Complex (mdtutorials.com)里面的案例5进行，用的是acpype，但是添加离子的时候报错，因为网上找不到完整的教程，试过一些网上的解决办法也不管用，可能是水平有限，所以请老师指点，感谢！我所 ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-2-13 05:06:13

jia1012428 发表于 2023-2-13 04:10
谢谢回复，我试过放到前面，也是一样的报错，请问怎么解决

单纯没改对而已
ppt里强调了，grompp看到的是所有include被展开后的文件，包括include里的include。仔细检查

jia1012428 发表于 Post on 2023-2-13 04:10:19

sobereva 发表于 2023-2-12 04:16
老生常谈的问题

谢谢回复，我试过放到前面，也是一样的报错，请问怎么解决

sobereva 发表于 Post on 2023-2-12 04:16:23

老生常谈的问题

顺带一提，网上都是零七八碎的教程，完整系统性学习参加北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）是最好的途径，各种类型问题所有例子文件都完整提供，各种要点和背景知识都讲得极其细致，碰见诸如此类问题立马知道怎么解决

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