已解决：调整轨迹无法将两条多肽居中

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发布时间: 2022-11-23 18:13

本帖最后由 wyfgg 于 2022-11-24 13:36 编辑各位老师好，我目前在做一个由两条多肽链AB组成的蛋白-配体MD，这个蛋白在实际上会自然分裂为A和B两个链。 1、盒子最初设置为10埃，在轨迹中发现B链突然跑到A链左边 ...

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wyfgg 发表于 Post on 2022-11-24 13:36:43

sobereva 发表于 2022-11-24 02:13
先用-pbc nojump得到两条链埃在一起的轨迹，再用-pbc cluster处理或者-center令蛋白质部分居中

谢谢Sob老师，已经解决

sobereva 发表于 Post on 2022-11-24 02:13:38

先用-pbc nojump得到两条链埃在一起的轨迹，再用-pbc cluster处理或者-center令蛋白质部分居中

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