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关于文献中催化剂迁移过渡态的问题

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发布时间: 2022-10-3 16:06

正文摘要:

本帖最后由 z0gh 于 2022-10-3 16:07 编辑 各位老师好,最近看到一篇文献中一个反应过程,不是很理解。如下图,由中间体D'到E’的过程,不存在过渡态。将文章中SI的坐标考出,仔细看了一下D'到E’的过程,作者是 ...

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z0gh 发表于 Post on 2022-10-4 18:49:12
wzkchem5 发表于 2022-10-4 15:39
可能的因素有很多,静电吸引是一方面,还有比如说芳构化、产物1-2位双键和周边双键的共轭、反应物的联烯 ...

谢谢老师的回答。
wzkchem5 发表于 Post on 2022-10-4 15:39:02
z0gh 发表于 2022-10-4 07:57
老师,还有一个问题。由D’到E'过程反应可能的驱动力是什么?是不是热力学驱动的过程(能量降低约20kal/m ...

可能的因素有很多,静电吸引是一方面,还有比如说芳构化、产物1-2位双键和周边双键的共轭、反应物的联烯不稳定等等。当然这些全都属于热力学驱动的一部分。真正重要的是解释其中哪个因素最重要,这个可能需要一些能量分解分析才能知道。
z0gh 发表于 Post on 2022-10-4 14:57:57
wzkchem5 发表于 2022-10-4 00:12
对于计算反应速率没有意义,但是对于理解这个反应的本质有意义。
对于一般的反应来说,知道反应物、过渡 ...

老师,还有一个问题。由D’到E'过程反应可能的驱动力是什么?是不是热力学驱动的过程(能量降低约20kal/mol)还是金属上的电子与碳3位正电荷的静电相互吸引作用导致的1,3-迁移?
z0gh 发表于 Post on 2022-10-4 08:45:00
wzkchem5 发表于 2022-10-4 00:12
对于计算反应速率没有意义,但是对于理解这个反应的本质有意义。
对于一般的反应来说,知道反应物、过渡 ...

感谢老师的回答。
wzkchem5 发表于 Post on 2022-10-4 00:12:33
z0gh 发表于 2022-10-3 16:10
非常感谢老师的回答。如果C'到E'是一步反应,通过过渡态TsD'进行,那D'这个中间体明确写出来是不是没有什 ...

对于计算反应速率没有意义,但是对于理解这个反应的本质有意义。
对于一般的反应来说,知道反应物、过渡态、产物结构,基本可以知道整个反应路径(也就是IRC)大概长什么样。但是对于个别的同时形成/断裂好几根键的反应,光知道IRC上的这三个点还无法唯一还原这个反应是怎么发生的(比如成断键的顺序),这时额外给一两个IRC上的结构有助于理解这个反应是怎么发生的。好比本来只知道发生了一个极其复杂的重排反应,但是IRC上多给几个结构就可以看出来,原来是先成环,金属再发生1,3-迁移。之后改善催化剂就比较容易一些了,可以从金属有机常识来分析,金属、配体的电性和位阻怎么改变有利于成环,怎么改变有利于1,3-迁移,等等。

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z0gh 发表于 Post on 2022-10-3 23:10:43
wzkchem5 发表于 2022-10-3 16:19
按理说,无过渡态的过程,反应物或产物中至少有一个应该是双分子的(或者更多分子)。不然的话一个很明显的 ...

非常感谢老师的回答。如果C'到E'是一步反应,通过过渡态TsD'进行,那D'这个中间体明确写出来是不是没有什么意义?
wzkchem5 发表于 Post on 2022-10-3 16:19:59
按理说,无过渡态的过程,反应物或产物中至少有一个应该是双分子的(或者更多分子)。不然的话一个很明显的问题,如果D'到E'没有过渡态且能量降低,那么优化D'的结构应该直接优化到E',根本优化不出D'的结构。
除非作者的意思是这个反应是一步从C'到E'的,D'是IRC上面取的一帧。这样的话可以说得通,但是比较严谨的说法是这是一个协同异步过程,而不是一个有过渡态的反应接续一个无过渡态的反应。

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