您好,我在计算热导率的时候,NPT之后进行NVE也出现了温度逐渐升高,导致最后计算热导率的时候报错,这个问题您有解决吗? |
请问解决了吗?我的温度是蹭一下直接两千,然后显示原子少了一个 |
lizhi333 发表于 2022-4-21 10:42 同问,你解决了吗 |
你好,请问问题解决了么?最后如何解决的呢? |
caiziqi 发表于 2022-1-5 10:37 那估计就是某些原子在升温过程中速度过大,根据该速度计算出的下一步位移过大,重新更新neighbourlist前,原子移动出模拟区域超过1倍的盒子长度(或处理器子区域长度),原子就被认为是丢失了。可以试试1,reduce timestep;2,change neighbour list bin to larger ones so that they could find the 'far' atoms;3,update neighbour list more frequently,like “neighbor_modify every 2” (参考 http://bbs.keinsci.com/thread-17903-1-1.html)。 |
chema 发表于 2022-1-5 09:52 我一开始就是设置成p p p,应该不是这个原因 |
是不是周期性边界条件的问题,没设成周期性的就会发生原子丢失 |
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