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求助：在能量最小化时遇到Atomtype not found问题

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wangdafeixh

发布时间: 2021-10-29 15:00

正文摘要:

通过ATB生成小分子文件，下载了gromos54a7力场文件在进行能量最小化gmx grompp -f em.mdp -c complex_SOL.gro -p topol.top -o em.tpr 出现错误Atomtype HS14 not found 查看力场文件atomtypes.atp中包含HS14 ...

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王肖索 发表于 Post on 2025-4-10 19:18:40

楼主问题解决了吗？

绪山真寻 发表于 Post on 2024-2-22 19:19:30

wangdafeixh 发表于 2021-10-29 19:20
sob老师，我用的gromos54a7力场文件就是在ATB网站上保存的

您好，我也遇到了这个问题，想自己修改力场文件，请问您解决了吗

sobereva 发表于 Post on 2021-10-29 18:56:52

这是ATB开发者基于GROMOS力场自己扩展的原子类型，必须在top里include ATB网站上提供的扩展版GROMOS力场包

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