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用Multiwfn分析跨桥/跨空间电荷转移(TB/TSCT)的思路和脚本:tstb

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发布时间: 2020-7-22 16:15

正文摘要:

本帖最后由 ggdh 于 2020-7-22 18:34 编辑 0. 前言 跨空间电荷转移的体系比较典型的一个模式图如下图所示 D和A分别是电子给体和受体。他们都连接在桥上,同时他们在空间上也靠近。 于是一个自然而然的的问题就 ...

回复 Reply

朱子豪 发表于 Post on 2025-6-18 07:28:24
我的问题解决啦,安装路径中有一个空格,Linux系统识别时容易报错,我把安装路径中有空格的文件夹名称更改一下,重新配置环境就好了
朱子豪 发表于 Post on 2025-6-16 16:36:20
楼主您好,我安装了WSL并且,下载配置好了Linux版本的Multiwfn,但是运行脚本一直报错,想请教一下您,感谢!“zzh@LAPTOP-LTMH4CC5:~/software/Multiwfn Linux$ ./tstb -m td -n 5 -g 3 -b 1-8,10-13,33-39 -d 9,14-32,40-52 -a 53-90 DM-B.fchk DM-B.log
/home/zzh/software/Multiwfn Linux/Multiwfn
(standard_in) 2: syntax error
EOF encountered in a comment.
(standard_in) 1: syntax error
EOF encountered in a comment.
(standard_in) 1: syntax error
TS/TB using transition density:
Through Space CT: 0.00000    0.00%
Through Bond  CT: 0.00000    0.00%
Tot transit dens: 0.00000”这些是报错内容
quyp22 发表于 Post on 2025-2-22 12:02:14
偶遇龙猫 发表于 2021-12-26 10:50
老师您好,看了您的这个方法我进行了我的计算,计算跃迁密度的分布和空穴电子重叠分布时都可以计算出结果, ...

回复32楼:因为Multiwfn更新过,在计算IFCT时多了选项“1 Mulliken-like partition”和“2 Hirshfeld partition”. 原来的脚本里没有这个选项所以报错了。需要在tstb那个脚本的第149行(8)和第150行($2)之间插入一行,写个1或者2(看你用哪种方法)之后就能运行了。
limalvis 发表于 Post on 2023-9-19 17:04:57
感谢钟老师,又多了一个可以写进去分析的点
人心向背 发表于 Post on 2023-7-31 12:11:18
ggdh 发表于 2023-7-29 10:31
你着两个都是td方法啊,没看到你用he方法。
另外 td方法里面不应该出现负值。

he的结果和td的一样,就没摆出来,我也好奇为啥会算出来负值,会不会是受体基团氧原子的影响
ggdh 发表于 Post on 2023-7-29 10:31:23
人心向背 发表于 2023-7-23 14:17
老师好,我在利用您的脚本计算两个TSCT的分子的跨桥/跨空间电荷转移(TB/TSCT)的比例时,(蓝色是供体,红色 ...

你着两个都是td方法啊,没看到你用he方法。
另外 td方法里面不应该出现负值。
人心向背 发表于 Post on 2023-7-23 14:18:57
两个分子s1的NTO如下

图片1.png (52.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 161)

图片1.png

图片2.png (48.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 159)

图片2.png
人心向背 发表于 Post on 2023-7-23 14:17:13
老师好,我在利用您的脚本计算两个TSCT的分子的跨桥/跨空间电荷转移(TB/TSCT)的比例时,(蓝色是供体,红色是受体,黑色是桥),通过td和he 方法计算的TSCT比例超过100%,两种方法的计算结果相同,下面是td的结果。请问为什么会出现这种情况呢?

a4-d4.png (70.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 164)

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1.png (16.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 161)

1.png

a5-d2.png (52.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 165)

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2.png (13.88 KB, 下载次数 Times of downloads: 165)

2.png
guodx 发表于 Post on 2022-12-6 21:24:51
老师好,我是一个菜鸟,请问您在1分析思路中b)具体做法的第二步提到的删掉中间的Π桥波函数是什么意思呢?谢谢指教
虎王 发表于 Post on 2022-6-17 15:49:49
小范范1989 发表于 2022-6-17 08:32
当时我记得第一次看的时候(你懂的),通讯是杨老师,实验为主,后面看到了钟老师的名字,所以当时 ...

那确实呀!
小范范1989 发表于 Post on 2022-6-17 08:32:01
虎王 发表于 2022-6-16 16:01
没写作者姓名吗?

当时我记得第一次看的时候(你懂的),通讯是杨老师,实验为主,后面看到了钟老师的名字,所以当时就知道,这里面的计算肯定是钟老师做的。
虎王 发表于 Post on 2022-6-16 16:01:04
小范范1989 发表于 2020-7-23 17:11
当时看文章的时候,一猜就是钟老师团队做的计算。

没写作者姓名吗?
虎王 发表于 Post on 2022-6-16 16:00:28
ggdh 发表于 2020-7-23 09:05
1,跃迁密度是先乘在取绝对值。空穴电子重叠是先取绝对值再乘,所以大概就是一样的?我没研究数学上是否 ...

那个,“在取绝对值”的“在”是“再”。
酸甜小柠檬 发表于 Post on 2022-5-29 18:21:06
ggdh 发表于 2022-5-27 00:40
可以的, 只要空穴和电子能够因为某种原因分别出现在供体和受体上

哦哦 好的 谢谢老师

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