xdat2xyz.pl脚本输出的xyz轨迹文件显示不全求助

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发布时间: 2020-6-18 19:00

通过下载的xdat2xyz.pl脚本（见附件）将vasp输出的XDATCAR转换为xyz轨迹文件后，用vmd,vesta,jmol等查看都出现分子显示不全的问题，请教各位老师如何能使分子全部完整显示。

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weichengdo 发表于 Post on 2020-6-29 22:10:44

你的这个脚本我的报错第七行 zip

sobereva 发表于 Post on 2020-6-18 20:17:06

如果是被盒子截断所致，在VMD里显示周期镜像就完了。要么尝试用VMD自带的pbctools工具恰当处理轨迹

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