跟我的一样,服务器总是会死机,一死机什么都动不了,只能强制关机 |
按文中扩展root分区的时候存在一些细节错误,可参考https://blog.csdn.net/qq_42103279/article/details/108714237 |
gog 发表于 2020-6-12 12:00 在环境变量.bashrc里将Intel mkl相关的环境变量注释#掉;或者在其他文件(需自己查找)中启用的Mkl库的设置注释掉;要么卸载intel studio(ifort), 重新将intel studio安到一个docker,系统调用intel mkl时,只需启动docker,docker类似虚拟机,使用方法可自行搜索。 |
只加载了intel mkl,另外是gcc的openmpi3.1.4.,运行就这么中招。忘记改怎么处理了。 libgomp: Invalid value for environment variable OMP_STACKSIZE [file orca_main/maininp1.cpp, line 15080]: Line 2 of test.inp (NPRO) |
gog 发表于 2020-6-11 17:02 需要调用库的,估计超算上的mkl库和你的有冲突,或者有啥默认设置,可以加 | tee,时时查看输出,或者直接看orca的输出文件,有无报错;如果orca速度正常,无报错,其他不用管。我装那两个库之间冲突,导致orca直接运行报错,卸载了其中Intel的库,只用openmpi313库,orca运行正常。 |
orca计算,需要调用mkl数学库么?我在本地安装好openmpi3.1.4,计算只是加载orca可执行文件,读入inp参数,然后就自动卸载了。日志上不报错,但和超算上的记录,少了几何优化和优化后最终的结构。 |
本帖最后由 欢乐多 于 2020-6-4 19:09 编辑 冰释之川 发表于 2020-6-4 17:00 哈哈,作为我的第一帖,人生的第一次总有或这或那的不完美。 |
highlight 发表于 2020-6-4 16:01 嗯,还有需要改进的地方,下次装的时候,改进一下。 不过,对于我来说,能装好就已经开挂啦。 |
gaussion (x) --> gaussian (✔) |
centos8 都出来了 |
调整分区的过程太麻烦,走弯路了。 安装的时候就有格式化和分区的选项,只不过 sob 的视频里默认自动分区了,你有特殊需要的话可以自己改的。 而且,自动分区搞的 Centos-root 是挂载 / 的,不是 /root。 你给 / 加的 1.3T 实在太多, 正常情况下 200G 就绝对够用了。这样白白浪费存储空间,会导致用于存放数据的 /home 过小。 另外,建议直接用 UEFI 安装,也就多了几步而已(linux 的 UEFI 启动盘不就要用 Ultroiso),适用性广,这个只是建议哈。。。 |
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