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如何判断反应生成的是自由基还是离子呢?

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发布时间: 2020-2-24 20:05

正文摘要:

想求助一下各位,如何判断反应生成的是自由基还是离子呢?例如HSO5-生成SO4-和OH-,vasp怎么判断哪个是自由基呢?

回复 Reply

Flights 发表于 Post on 2020-4-11 12:46:05

谢谢老师了哈~
sobereva 发表于 Post on 2020-4-6 20:28:49
Flights 发表于 2020-4-5 10:24
老师,它的输出是这个样子,那个netcharge是不是就是对应的mulliken charge?

sobereva 发表于 Post on 2020-4-4 05:07:51
Flights 发表于 2020-4-2 09:51
老师我又来请教了。我用cp2k算好了Mulliken布居,可以直接通过mulliken的输出来确定它是否为自由基吗?

如果给你了自旋布居,可以拿来判断
Flights 发表于 Post on 2020-4-2 09:51:46
sobereva 发表于 2020-2-25 18:19
Gaussian或者ORCA,用簇模型研究(截出片段,边界饱和),结合Multiwfn各种各样的分析都能做。此文就是很 ...

老师我又来请教了。我用cp2k算好了Mulliken布居,可以直接通过mulliken的输出来确定它是否为自由基吗?
Flights 发表于 Post on 2020-3-2 08:50:10
卡开发发 发表于 2020-2-29 13:51
量子化学里面电荷是离域的,该有电荷转移的情况合适的方法应该算出来就会表现出电荷转移。

好的,谢谢大佬!
卡开发发 发表于 Post on 2020-2-29 13:51:59
Flights 发表于 2020-2-29 13:46
嗯嗯,目前我也是这么想的,比如加进去一个Na+ 或者 H+,但是就怕vasp识别为H原子和Na原子

量子化学里面电荷是离域的,该有电荷转移的情况合适的方法应该算出来就会表现出电荷转移。
Flights 发表于 Post on 2020-2-29 13:46:35
卡开发发 发表于 2020-2-26 17:02
表面的话VASP没办法处理带电荷的情况。也许可以通过加反电荷的离子避免这种问题。

嗯嗯,目前我也是这么想的,比如加进去一个Na+ 或者 H+,但是就怕vasp识别为H原子和Na原子
卡开发发 发表于 Post on 2020-2-26 17:02:08
Flights 发表于 2020-2-26 14:49
感谢回复!请问,可以通过设置NELECT来进行计算带电体系吗?比较纠结的是,怎么让vasp知道我加进去的是离 ...

表面的话VASP没办法处理带电荷的情况。也许可以通过加反电荷的离子避免这种问题。
Flights 发表于 Post on 2020-2-26 14:49:08
卡开发发 发表于 2020-2-26 07:25
vasp或其他周期性程序计算也是同样的,看自旋密度或自旋布居就行,核心问题是,带电荷的表面用VASP不怎么 ...

感谢回复!请问,可以通过设置NELECT来进行计算带电体系吗?比较纠结的是,怎么让vasp知道我加进去的是离子还是原子呢?
卡开发发 发表于 Post on 2020-2-26 07:25:53
Flights 发表于 2020-2-24 20:26
谢谢老师,应该是我没有表达清楚。我的原意是HSO5-可能会分解成两个物质,怎样判断生成的产物哪个是自由 ...

vasp或其他周期性程序计算也是同样的,看自旋密度或自旋布居就行,核心问题是,带电荷的表面用VASP不怎么容易处理。
Flights 发表于 Post on 2020-2-25 20:30:02
sobereva 发表于 2020-2-25 18:19
Gaussian或者ORCA,用簇模型研究(截出片段,边界饱和),结合Multiwfn各种各样的分析都能做。此文就是很 ...

好的好的,谢谢老师!
sobereva 发表于 Post on 2020-2-25 18:19:39
Flights 发表于 2020-2-24 20:35
体系是研究碳材料对PMS活化的影响,计算活化能垒。但是就是不知道怎么确定产物是离子还是自由基。那老师 ...

Gaussian或者ORCA,用簇模型研究(截出片段,边界饱和),结合Multiwfn各种各样的分析都能做。此文就是很好的范例ACS Catal. 2018, 8, 3825−3832
Flights 发表于 Post on 2020-2-24 20:35:29
sobereva 发表于 2020-2-24 20:28
我不知道有什么理由要用VASP算这个,远不如量化程序合适,分析手段也很匮乏

体系是研究碳材料对PMS活化的影响,计算活化能垒。但是就是不知道怎么确定产物是离子还是自由基。那老师可以推荐一些适合的计算程序嘛?目前就只算过vasp和cp2k~

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