Interaction Entropy：相互作用熵

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发布时间: 2019-7-28 21:48

本帖最后由 puzhongji 于 2019-7-28 22:13 编辑蛋白质-配体结合自由能的高效和可靠计算是计算生物学中的重大挑战，并且在药物设计和其他分子识别问题中是至关重要的。目 ...

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msjy 发表于 Post on 2024-5-8 11:46:17

xiaotianzhou 发表于 2021-1-8 16:40
老师好。计算相互作用熵的python脚本可以发一份给我吗？万分感谢。我的邮箱：

老师好，可以把相互作用熵的python脚本实现分享一份吗？谢谢您！我的邮箱：1570365086@qq.com

放飞梦想2018 发表于 Post on 2023-12-6 19:43:11

为何没有回复？

buxizhou 发表于 Post on 2021-10-27 11:06:06

zheny1379 发表于 2021-1-15 22:02
可以加我qq：1965759414 相互交流一下

您好，我最近在学习ASIE方法的使用，可以向您请教一下吗？我已经在qq上向您申请好友了，麻烦通过一下可以吗？不好意思打扰了。

zheny1379 发表于 Post on 2021-1-15 22:02:11

本帖最后由 zheny1379 于 2021-11-24 09:56 编辑

xiaotianzhou 发表于 2021-1-8 16:40
老师好。计算相互作用熵的python脚本可以发一份给我吗？万分感谢。我的邮箱：

xiaotianzhou 发表于 Post on 2021-1-8 16:40:44

zheny1379 发表于 2021-1-6 15:10
相互作用熵计算过程用python脚本实现如有需要请联系我

老师好。计算相互作用熵的python脚本可以发一份给我吗？万分感谢。我的邮箱：zhou0128@e.ntu.edu.sg

zheny1379 发表于 Post on 2021-1-6 15:10:39

本帖最后由 zheny1379 于 2021-11-24 10:40 编辑

相互作用熵计算过程要先看懂原文

yogurt 发表于 Post on 2020-6-12 15:53:05

请问这里的K和β是什么？

cesc2020 发表于 Post on 2020-3-9 14:28:02

本帖最后由 cesc2020 于 2020-3-16 09:28 编辑

写的挺好

Shine剪水 发表于 Post on 2019-7-29 10:40:20

fhh2626 发表于 2019-7-28 23:47
这个方法推导的时候把反应物和生成物的能量混在一起弄成系综平均了，也就是说实际上只有反应物和生成物能量 ...

老师，您这里的“这个近似恐怕太严厉了”是该近似导致的误差会偏大对吧？

fhh2626 发表于 Post on 2019-7-28 23:47:31

本帖最后由 fhh2626 于 2019-7-29 00:07 编辑

这个方法推导的时候把反应物和生成物的能量混在一起弄成系综平均了，也就是说实际上只有反应物和生成物能量相等的时候那个公式才满足。。。在一些docking的情况下应该可以用吧，分子模拟的话这个近似恐怕太严厉了

参与人数 Participants 1	eV +1	收起理由 Reason
sobereva	+ 1

xpyp 发表于 Post on 2019-7-28 23:38:37

请问，上式中的 K 和 β分别是什么？

Novice 发表于 Post on 2019-7-28 21:54:21

提示一下，你提到的几个公式是路径，看不到图片。

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