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求助：slab优化后结构变化太大原因是什么？

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飞翔的猪

发布时间: 2019-6-1 13:42

正文摘要:

本帖最后由飞翔的猪于 2019-6-1 13:45 编辑大家好，最近做Cu3P的slab优化，发现优化前后结构变化特别大，原子位置偏移非常大，我优化了两次，实验了加偶极校正和不加偶极校正，发现：优化出来的结构偏差都很大 ...

回复 Reply

kkk99999 发表于 Post on 3 day ago

sky 发表于 2019-6-1 21:21
原子位置偏移非常大以及优化后的结构完全乱了，九成是输入文件错了，特别是POSCAR和POTCAR里元素不对应。
...

我也遇到一样的问题发现最后一个原子Br写成B的赝势了，不过元素不对应也能进行计算的吗

kingbb 发表于 Post on 2024-10-23 10:15:05

卡开发发发表于 2024-9-17 12:21
可以。

谢谢卡卡老师，已经给您发生好友申请了

卡开发发 发表于 Post on 2024-9-17 12:21:13

kingbb 发表于 2024-9-16 21:29
我可以私发给卡卡老师吗？

可以。

kingbb 发表于 Post on 2024-9-16 21:29:48

卡开发发发表于 2024-9-16 20:07
不好说，得看具体的体系和计算参数。

我可以私发给卡卡老师吗？

卡开发发 发表于 Post on 2024-9-16 20:07:56

kingbb 发表于 2024-9-16 17:31
请问卡卡老师，这种Cu体系晶体做吸附和结构优化时，出现结构跑散的问题有方法解决吗？我最近也在算Cu体系 ...

不好说，得看具体的体系和计算参数。

kingbb 发表于 Post on 2024-9-16 17:31:04

卡开发发发表于 2019-6-1 14:07
我想可能是固定的原因，但我不确定这么做一定是合理的。另外k点我不确定你是否认真测试过。之前我自己用其 ...

请问卡卡老师，这种Cu体系晶体做吸附和结构优化时，出现结构跑散的问题有方法解决吗？我最近也在算Cu体系晶体，发现进行吸附优化时，结构很容易优化到散架，试了很多参数都不行。

kingbb 发表于 Post on 2024-9-15 22:48:50

同学，请问这个问题解决了吗，我也在算Cu化合物，发现结构优化后，晶体原子排布都不稳定

朱陈 发表于 Post on 2022-3-27 18:33:11

卡开发发发表于 2022-3-27 16:51
这个确实得根据实验，计算要确定诸多因素比较困难，比如要论证稳定性就得分热力学和动力学稳定性两方面， ...

谢谢老师指点

卡开发发 发表于 Post on 2022-3-27 16:51:39

朱陈发表于 2022-3-27 16:32
感谢老师回复，请问老师如何确定重构后的结构存在，是根据实验上的表征吗?谢谢老师！

这个确实得根据实验，计算要确定诸多因素比较困难，比如要论证稳定性就得分热力学和动力学稳定性两方面，这些实际做起来不大容易。

朱陈 发表于 Post on 2022-3-27 16:32:26

卡开发发发表于 2022-3-27 16:29
如果重构后的结构确实存在且具备催化活性，也并非不能用来研究，稳定的表面不见得适合用来做催化。

感谢老师回复，请问老师如何确定重构后的结构存在，是根据实验上的表征吗?谢谢老师！

卡开发发 发表于 Post on 2022-3-27 16:29:04

朱陈发表于 2022-3-27 16:19
卡开发发老师，打扰您了，请问如果表面结构发生严重重构是不是意味着不适合用来研究表面催化反应了。谢谢 ...

如果重构后的结构确实存在且具备催化活性，也并非不能用来研究，稳定的表面不见得适合用来做催化。

朱陈 发表于 Post on 2022-3-27 16:19:23

卡开发发发表于 2019-6-1 14:07
我想可能是固定的原因，但我不确定这么做一定是合理的。另外k点我不确定你是否认真测试过。之前我自己用其 ...

卡开发发老师，打扰您了，请问如果表面结构发生严重重构是不是意味着不适合用来研究表面催化反应了。谢谢您

ccjjww25 发表于 Post on 2020-7-17 10:10:10

本帖最后由 ccjjww25 于 2020-7-17 10:13 编辑

sky 发表于 2019-6-1 21:21
原子位置偏移非常大以及优化后的结构完全乱了，九成是输入文件错了，特别是POSCAR和POTCAR里元素不对应。
...

十分感谢老师的解答，我也遇到了和帖主一样的问题，表面优化时原子都跑散了，看了老师回答才发现是POSCAR和POTCAR里元素不对应导致的。

1.png (20.92 KB, 下载次数 Times of downloads: 76)

sky 发表于 Post on 2019-6-1 21:21:12

原子位置偏移非常大以及优化后的结构完全乱了，九成是输入文件错了，特别是POSCAR和POTCAR里元素不对应。
加上各种矫正计算都只会在越来的结构上有稍微的偏移，现在的结果这么差，不可能加几个矫正就正常了。

飞翔的猪 发表于 Post on 2019-6-1 21:03:51

卡开发发发表于 2019-6-1 17:04
我觉得也是plain DFT对Cu这些化合物的描述有问题。VASP做DFT+U参考这里http://bbs.keinsci.com/thread-11 ...

谢谢您提供的链接我先学习一下

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