计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 第一性原理 (First-principles) › 自己编译的vasp5.3.5版本运行效率特别低，请大家帮忙看 ...

自己编译的vasp5.3.5版本运行效率特别低，请大家帮忙看看是什么问题。

查看数: 11508 | 评论数: 12 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

帖子模式

xylsm

发布时间: 2019-5-19 16:54

正文摘要:

本帖最后由 xylsm 于 2019-5-29 11:05 编辑去年按照论坛里的方法（http://bbs.keinsci.com/thread-4267-1-1.html），外加自己找了很多教程相结合，编译成功了vasp5.3.5，一直没怎么用。最近想要开始做一些计算看 ...

回复 Reply

ghifi37 发表于 Post on 2019-12-20 13:05:36

把build目录先对应版本删掉就可以重新编了

Siling_S 发表于 Post on 2019-12-19 22:37:17

想请问下我现在需要重新编译vasp把VTST加进去，应该怎么删除现有的VASP呢……

xylsm 发表于 Post on 2019-5-29 11:13:54

abin 发表于 2019-5-20 10:58
你全程在使用GNU的编译器操作；
有安装Intel编译器做什么？只用intel MKL不就行了？

谢谢！因为自己对这个编译理解不是很深，当时就参考了好几个教程，可能就混了。现在安装sob老师的教程重新编译了544版本，很好用！

xylsm 发表于 Post on 2019-5-21 13:21:24

zjxitcc 发表于 2019-5-20 13:46
一些简单的软件、在不提供uninstall功能时、装在个人目录下的话，直接移除目录即可。复杂的（像intel编译 ...

好的，太谢谢了，我先试着卸载再重新编译一下。有问题再和您请教！

zjxitcc 发表于 Post on 2019-5-20 13:46:11

xylsm 发表于 2019-5-20 11:08
差别这么大呀！而且我也搜了一下，好像是说Intel MPI 比 openmpi 的效率高，现在有点想把之前编译的全部 ...

一些简单的软件、在不提供uninstall功能时、装在个人目录下的话，直接移除目录即可。复杂的（像intel编译器）、提供uninstall的、用root安装导致一部分装在/usr/bin里的，这些情况不能直接移除安装目录，需要按说明卸载。

xylsm 发表于 Post on 2019-5-20 11:08:03

akakcolin 发表于 2019-5-20 10:47
用vasp544版本，我自己的案例曾测过速度同样的体系，vasp544比535快15%

差别这么大呀！而且我也搜了一下，好像是说Intel MPI 比 openmpi 的效率高，现在有点想把之前编译的全部卸载掉，然后重新编译5.4.4版本。不知道是不是linux下只要把安装的文件夹删除掉就可以？

abin 发表于 Post on 2019-5-20 10:58:58

你全程在使用GNU的编译器操作；
有安装Intel编译器做什么？只用intel MKL不就行了？

要不你把所有的编译器都修改为Intel的？不采用gnu的版本。

要么就是用新版的GNU编译器，编译用到的所有版本。

其实centOS就内置了采用GNU编译器编译好的全部东西，直接用不就得了。

不反对自己编译，但是不要乱编译，尤其是不要编译器混用。

alonewolfyang 发表于 Post on 2019-5-20 10:54:50

本帖最后由 alonewolfyang 于 2019-5-20 10:56 编辑

我是按照卢老师最简单编译方法编译的，测试后没啥问题，你要是觉得自己编译有问题，请严格按照这里的方法重新编译，再看看效果如何(PS:

一次就编译成功，在虚拟机里面)，http://bbs.keinsci.com/thread-11 ... etag=s_pctim_aiomsg

akakcolin 发表于 Post on 2019-5-20 10:47:52

用vasp544版本，我自己的案例曾测过速度同样的体系，vasp544比535快15%

akakcolin 发表于 Post on 2019-5-20 10:46:46

你应该用较新的intel的mpi 2013 的太老了吧，至少2015以上的吧 fftw 也用intel/mkl库里的

xylsm 发表于 Post on 2019-5-20 09:51:51

飞翔的猪发表于 2019-5-19 21:34
我是自己电脑装的vasp5.4.4，运算bulk模型的时候大概几分钟就可以算好了，但是涉及slab体系运算的时候，90 ...

我是按照刘老师的视频的theta-Al2O3计算例子做的练习，用它的原胞，总共只有10个原子，而且算的是单点。我自己的服务器是去年买的，2个cpu（Intel(R) Xeon(R) Gold 6138 CPU @ 2.00GHz），总共40个物理核心，内存196G，配置应该是比我测试的那个师兄的服务器高的，但是就是慢。它那里瞬间就算完了，我这边跑了应该至少有十分钟

那个师兄的服务器2个cpu（Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2660 v2 @ 2.20GHz），总共20个物理核心，内存32G，所以感觉可能还是vasp编译或者mpirun这个并行计算编译的问题

飞翔的猪 发表于 Post on 2019-5-19 21:34:42

我是自己电脑装的vasp5.4.4，运算bulk模型的时候大概几分钟就可以算好了，但是涉及slab体系运算的时候，90多个原子的时候，每步耗时就到200s以上，我觉得可能跟

电脑的配置、INCAR写法等方面相关，应该影响因素很多吧，出现相同的情况，仅交流一下

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register