计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

求助NAMD模拟蛋白质跑了一段时间后就会莫名其妙的掉下来[已解决]

查看数: 7775 | 评论数: 5 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2019-5-13 15:14

正文摘要:

本帖最后由 somniferum 于 2019-5-16 11:03 编辑 最近用NAMD做一个蛋白的模拟,这个蛋白也不复杂,我也是跟以前一样按步骤进行,并且成功run。但是在跑了一段时间后就会莫名其妙的掉下来。然后log文件显示错误为F ...

回复 Reply

fhh2626 发表于 Post on 2019-5-14 10:17:25
somniferum 发表于 2019-5-13 23:37
好的,我去试试,多谢

以前用天河一号的时候经常遇到这个问题
somniferum 发表于 Post on 2019-5-14 10:06:42
sobereva 发表于 2019-5-14 03:01
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出具体内容(仔细看http://bbs ...

好的社长,下回我会注意
sobereva 发表于 Post on 2019-5-14 03:01:35
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出具体内容(仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),我已把你的标题“请教一个关于NAMD的问题”改了,以后务必注意
somniferum 发表于 Post on 2019-5-13 23:37:45
fhh2626 发表于 2019-5-13 19:12
你是在超算上面跑的吗?感觉是硬盘的问题,你也可以把写入文件的频率调低点

好的,我去试试,多谢
fhh2626 发表于 Post on 2019-5-13 19:12:58
你是在超算上面跑的吗?感觉是硬盘的问题,你也可以把写入文件的频率调低点

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +4 收起 理由
Reason
somniferum + 4 运行了三天,感觉应该可以了,多谢指点

查看全部评分 View all ratings

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-18 07:16 , Processed in 1.039344 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list