求助：POSCAR原子固定选择

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发布时间: 2019-5-6 10:29

大家好，下图是VESTA导出的3层CuO(111)面，我想做表面吸附，固定2层原子，表面原子驰豫，如何根据这个图片或者POSCAR信息确定2层对应原子的坐标位置，谢谢 POSCAR为： poscar-CuO(111)-3layers 1.0 &n ...

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Penson 发表于 Post on 2020-8-21 20:55:25

活性炭发表于 2020-8-20 20:59
之前没有用过，请问，有教程么？

有，可以搜一下Bilibili啦啦嘿还嘿的分享视频，有单独一节介绍vaspkit

活性炭 发表于 Post on 2020-8-20 20:59:29

Penson 发表于 2020-8-20 18:46
直接用vaspkit就可以选择固定几层

之前没有用过，请问，有教程么？

活性炭 发表于 Post on 2020-8-20 20:58:42

cokoy 发表于 2020-8-20 17:29
我能打开啊。。要不你直接用vaspkit吧

你好，能具体说说怎么来固定么？或者有相关的链接么？

Penson 发表于 Post on 2020-8-20 18:46:18

直接用vaspkit就可以选择固定几层

cokoy 发表于 Post on 2020-8-20 17:29:13

活性炭发表于 2020-8-20 16:35
你好，这个链接打不开，请重发一下吧

我能打开啊。。要不你直接用vaspkit吧

lcq845402558 发表于 Post on 2020-8-20 17:00:28

VESTA有原子顺序的编号啊，对应在POSCAR的那一行。固定原子的帖子网上多得很，多搜一搜就好了。无非就是TTT FFF.
https://jingyan.baidu.com/article/0aa22375455ff488cc0d64b9.html

活性炭 发表于 Post on 2020-8-20 16:37:31

你好，请问这个问题解决了吗？请教一下具体怎么固定呢？

活性炭 发表于 Post on 2020-8-20 16:35:20

cokoy 发表于 2019-5-6 12:10
https://www.bigbrosci.com/2018/11/11/ex73/#more
上面链接里有脚本，或者你按Z方向坐标排序，然后固定两 ...

你好，这个链接打不开，请重发一下吧

飞翔的猪 发表于 Post on 2019-5-6 18:50:30

cokoy 发表于 2019-5-6 12:10
https://www.bigbrosci.com/2018/11/11/ex73/#more
上面链接里有脚本，或者你按Z方向坐标排序，然后固定两 ...

非常感谢提供的脚本参考，里面给的内容和操作还是挺详细的，我来学习一下，谢谢

cokoy 发表于 Post on 2019-5-6 12:10:58

https://www.bigbrosci.com/2018/11/11/ex73/#more
上面链接里有脚本，或者你按Z方向坐标排序，然后固定两层对应的Z以内的，再把顺序还原。

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