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求助:用GAFF跑完MD发现DME分子的结构不对劲,如何解决?

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发布时间: 2019-4-11 04:46

正文摘要:

老师好,大家好,我用GAFF跑完MD发现DME分子的结构不对劲,正常的结构应该是下图DFT算的那种吧,可是MD跑完后却是下图MD所示的结构。GAFF的参数是用antechamber+acpype.py自动生成的,自己算的RESP电荷,请问是这个 ...

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sobereva 发表于 Post on 2019-4-11 15:21:30
你MD跑的结果没什么硬性问题,本身C-O键就容易旋转。

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yihanxu + 5 谢谢

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