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Gromacs第二次能量最小化出现的问题

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发布时间: 2019-3-29 20:41

正文摘要:

想请教一下各位老师,我用自己的写的top文件和itp尝试了一下模拟。在grompp之后的mdrun命令时,出现了图示错误。我应该怎么改正呢?

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王精英 发表于 Post on 2019-3-30 08:57:39
sobereva 发表于 2019-3-30 01:19
我暂时没时间仔细看你的文件。我建议做能量极小化的时候总是用柔性水,即mdp里使用define = -DFLEXIBLE。如 ...

非常感谢您的回复!
sobereva 发表于 Post on 2019-3-30 01:19:27
我暂时没时间仔细看你的文件。我建议做能量极小化的时候总是用柔性水,即mdp里使用define = -DFLEXIBLE。如果还有问题,或者结果诡异,再去检查mdp其它部分、拓扑文件和结构

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