sobereva 发表于 2018-12-1 21:31
gmx trjconv -h一看就知道程序需要什么文件，怎么指定路径

好的，再次感谢~

Lacrimosa 发表于 2018-12-1 21:28
感谢回复~把tpr文件命名为topol.tpr放入目录后解决了，
借此还想再问您一下，如果运行trjconv指令必须要 ...

gmx trjconv -h一看就知道程序需要什么文件，怎么指定路径

sobereva 发表于 2018-12-1 20:59
需要提供tpr文件，你没提供，故程序自动去找当前目录下的topol.tpr

感谢回复~把tpr文件命名为topol.tpr放入目录后解决了，
借此还想再问您一下，如果运行trjconv指令必须要把tpr文件改为topol.tpr么？当我输入trjconv -f mini.tpr -pbc whole -o mini-1.gro的时候，又会报错提供xtc文件。所以就不太明白，在提供输入文件的时候怎么判断哪些是需要提供的呢？

Lacrimosa 发表于 2018-12-1 20:58
感谢您的回复，关于具体细节方面还想请教一下，我在gmx4.0.5输入：trjconv -f mini.gro -pbc whole -o mi ...

需要提供tpr文件，你没提供，故程序自动去找当前目录下的topol.tpr

liyuanhe211 发表于 2018-12-1 19:50
我看是纯显示问题，用trjconv转换一下就行了

感谢您的回复，关于具体细节方面还想请教一下，我在gmx4.0.5输入：trjconv -f mini.gro -pbc whole -o mini-1.gro
出现报错：Can not open file：topol.tpr
请问这个该怎么解决

Lacrimosa 发表于 2018-12-1 16:19
补一下图片，请各位见谅

我看是纯显示问题，用trjconv转换一下就行了