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简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

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发布时间: 2018-6-5 10:16

正文摘要:

虽然本论坛有专门的Multiwfn板块,但还是老有人问Multiwfn问题的时候跑到量化版的“简单量子化学问题答疑专帖”(http://bbs.keinsci.com/thread-33965-1-1.html),这样不好。 遂这里专门开一个“简单Multiwfn使 ...

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shobuu 发表于 Post on yesterday 12:22
sobereva 发表于 2025-8-21 03:29
图太乱,都看不清楚等值面的特征

算NO单体的时候,如果用背景电荷表示另一部分体系,由于有外场的作用 ...

好的,谢谢老师指导~
sobereva 发表于 Post on yesterday 03:29
shobuu 发表于 2025-8-21 00:43
卢老师您好!做了一氧化氮吸附体系的电子密度差图。结果上看起来像是电子从NO的其中一个π反键轨道转移到了 ...

图太乱,都看不清楚等值面的特征

算NO单体的时候,如果用背景电荷表示另一部分体系,由于有外场的作用,电子结构就不会随机了
shobuu 发表于 Post on yesterday 00:43
本帖最后由 shobuu 于 2025-8-21 12:21 编辑

卢老师您好!做了一氧化氮吸附体系的电子密度差图。结果上看起来像是电子从NO的其中一个π反键轨道转移到了跟它垂直的另外一个π反键轨道上。NO的π反键轨道其实是简并轨道,猜测是单体单点能计算的时候,程序随机选了一个π反键轨道填充NO的单电子,正好不是复合物中NO单电子填充的那一个,造成了有内部跃迁的假象。请问有没有可能在NO单体单点能计算的时候,规定单电子填充在和复合物中一样的那个π反键轨道中呢?

sobereva 发表于 Post on 2025-7-18 06:09:26
DUTHUANGXY 发表于 2025-7-17 22:50
使用能量分解分析 分析原子对色散作用的贡献时,无论读取MOL2或GJF或XYZ文件,选择选项1或者2会直接闪退, ...

先重复博文的例子,确保操作无误
使用Multiwfn图形化展现原子对色散能的贡献以及色散密度
http://sobereva.com/705http://bbs.keinsci.com/thread-44723-1-1.html

如果唯独你自己的体系不行,上传输入文件、贴完整的操作过程。提问时提供的信息必须尽可能充分。

以examples\phenol.xyz为例,Multiwfn的输出信息都在附件里,可见目前的最新版没有任何问题
phenol.txt (4.79 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)
DUTHUANGXY 发表于 Post on 2025-7-17 22:51:01
DUTHUANGXY 发表于 2025-7-17 22:50
使用能量分解分析 分析原子对色散作用的贡献时,无论读取MOL2或GJF或XYZ文件,选择选项1或者2会直接闪退, ...

是最新版Multiwfn
DUTHUANGXY 发表于 Post on 2025-7-17 22:50:09
使用能量分解分析 分析原子对色散作用的贡献时,无论读取MOL2或GJF或XYZ文件,选择选项1或者2会直接闪退,生成一个XYZ文件和一个空TXT文件,请问该如何解决?试了各种文件,结果都一样,求助各位!
sobereva 发表于 Post on 2025-7-13 06:21:44
吴双 发表于 2025-7-12 14:48
老师 想跟您请教下,Multiwfn可以计算分子体系两个原子之间的COHP么,看了Multiwfn的Software Manual (vers ...

把那两个原子各定义为一个片段就完了

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吴双 + 3 好的 谢谢老师

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吴双 发表于 Post on 2025-7-12 14:48:36
老师 想跟您请教下,Multiwfn可以计算分子体系两个原子之间的COHP么,看了Multiwfn的Software Manual (version 3.8 (dev)),4.10.7 Plot COHP for C60 fullerene and N-phenylpyrrole里面的例子,没找到原子之间COHP计算的选项
ttdycb 发表于 Post on 2025-6-30 20:03:25
sobereva 发表于 2025-6-30 18:03
仔细看文末的红字部分
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频 ...

谢谢sob老师
sobereva 发表于 Post on 2025-6-30 18:03:19
ttdycb 发表于 2025-6-30 16:28
各位老师,利用VMD绘制ESP图时,双击ESPiso之后,打开VMD输入iso后,为什么ESP图没有颜色呀,是黑白的呢, ...

仔细看文末的红字部分
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)
http://sobereva.com/443http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html
2877321934 发表于 Post on 2025-6-30 17:49:14
sobereva 发表于 2025-6-27 06:41
不能
ORCA跑AIMD可以要求每隔一定帧数输出一次gbw,各个gbw是独立的,Gaussian没这个功能

好的,谢谢老师
ttdycb 发表于 Post on 2025-6-30 16:28:52

VMD绘制ESP图的求助

各位老师,利用VMD绘制ESP图时,双击ESPiso之后,打开VMD输入iso后,为什么ESP图没有颜色呀,是黑白的呢,期待老师的回复

ESP.png (53.73 KB, 下载次数 Times of downloads: 123)

ESP.png
sobereva 发表于 Post on 2025-6-30 05:47:39
18217265596 发表于 2025-6-27 09:03
老师 请问这样的igmh_inter 散点图
我描述成吸引和排斥都存在但是很弱的范德华相互作用 是合适的对吗?
...

永远不要只摆出一个散点图
给出散点图的前提是先给出填色等值面图

参考下文
http://sobereva.com/291
2.10 老师,您看我的散点图(发来图片...),能说明其中有弱相互作用么?
绝对不要光看散点图!要先看RDG填色等值面图,弱相互作用在什么位置、什么特征一目了然。有那么直观的等值面图不看干嘛非要只看一张特别抽象的散点图?光给出散点图的话别人都不知道你的体系是什么结构。仅当需要定量考察、对比的时候才应当结合散点图一起看。


18217265596 发表于 Post on 2025-6-27 09:03:36
老师 请问这样的igmh_inter 散点图
我描述成吸引和排斥都存在但是很弱的范德华相互作用 是合适的对吗?
第一次描述igmh 散点图

微信截图_20250627090244.png (101.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 247)

微信截图_20250627090244.png

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