计算化学公社

标题: 请教如何用VASP模拟文献中的反应过程（文献内容和原文已附） [打印本页]

作者
Author: qwe1832518773 时间: 2018-4-15 18:30
标题: 请教如何用VASP模拟文献中的反应过程（文献内容和原文已附）
各位老师各位同仁，我自己平时做计算用的都是gaussian，对于VASP不是太了解，所以在看文献的时候对于用VASP模拟反应过程有几个很基础的问题，文献正文和SI都附在文末，希望各位不吝赐教

1、一直很想知道像附件中这段描写用VASP是如何操作的“Our AIMD simulations were performed using a cubic box of side length 9.278 Å with periodic conditions; each simulation box consists of 2MEA, 1CO2, and 20H2O molecules, corresponding to E25 wt% aqueous MEA solution.”（出现在正文Fig 1的下方）
是用VASP建立一个盒子，设定一些盒子的边界条件，然后把2MEA, 1CO2, 和 20H2O分子直接丢进盒子里等着它自己运算吗？如果有关于这部操作的详细案子或教程最好

2、还有这个图（正文Fig 1）
(, 下载次数 Times of downloads: 20)
这些一步一步的过程都是通过问题1中设置好的盒子自动运算得到的一系列结果吗？可以用类似gaussview的软件读取查看吗？还是属于自己猜想的？

3、还有这个图(SI中的Fig S1)
(, 下载次数 Times of downloads: 29)
这是文献中计算反应能的一张图，对于30%浓度的MEA，开始设置盒子里的分子是2MEA, 1CO2和 16H2O，那另外这一组1MEACOO-, 1MEAH+和16H2O是这个盒子在软件自己运算之后得出的结果吗？还是重新设置了一个包含1MEACOO-, 1MEAH+和16H2O的新盒子？

我自己用Gaussian计算能量最后会收敛，起码不是这样波动的吧，VASP计算能量就是这样一直波动的吗？

正文： (, 下载次数 Times of downloads: 16)
SI： (, 下载次数 Times of downloads: 9)

欢迎光临计算化学公社 (http://ccc.keinsci.com/)