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标题: 运行能量最小化出现System I/O error，这个怎么解决啊 [打印本页]

作者
Author: zdy 时间: 2018-3-8 20:36
标题: 运行能量最小化出现System I/O error，这个怎么解决啊
本帖最后由 zdy 于 2018-3-8 20:46 编辑

跪求这个问题咋解决啊，运行最小化就卡住了。

System I/O error:

Library file 'residuetypes.dat' not foundin current dir nor in the default

directories.

The following paths were searched:

/sob/100 (current dir)

/sob/gmx2016.4/share/gromacs/top (default)

You can set additional directories to searchwith the GMXLIB path variable.

(, 下载次数 Times of downloads: 76) (, 下载次数 Times of downloads: 42) ，在运行的过程中还会出现如图片所示的现象，想问一下为什么出现这种情况，是模型构建不合理吗？（我是从ATB网站上下载下来的拓扑和结构文件）谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2018-3-8 21:21
正常安装完毕后，residuetypes.dat就应该在/sob/gmx2016.4/share/gromacs/top下面。检查此目录下到底有没有，如果没有，看到底这文件在哪里
mdp不合理（升温过快、步长太大等等）、初始结构不合理或者没做优化，或者top文件没弄对都可能导致

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