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标题: 如何体现水的酸碱性 [打印本页]

作者
Author: wx91aaa 时间: 2018-3-1 21:25
标题: 如何体现水的酸碱性
我想通过Gromacs研究水的酸碱性对醇类在水中的溶解度。参照培训班讲义里的添加Na和Cl离子的方法，没有在top文件里找到H离子和氢氧根的itp的文件。别的文献里体现体系酸碱性都是改变带电基团的性质。但是我的体系中除了水和醇没有其他基团了，该如何改变体系的酸碱性呢？谢谢各位大神了！！！

作者
Author: Graphite 时间: 2018-3-3 11:37
可以根据PH值适当改变水的质子化态，例如100个水分子中有10个是H3O+
如果自己不是很确定，可以用openbabel生成。

作者
Author: 02130213aaa 时间: 2018-3-4 21:37

Graphite 发表于 2018-3-3 11:37
可以根据PH值适当改变水的质子化态，例如100个水分子中有10个是H3O+
如果自己不是很确定，可以用openbabel ...

谢谢您！

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