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标题: 簇分析时进行能否进行分子索引 [打印本页]

作者
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02130213aaa    时间: 2018-1-18 14:14
标题: 簇分析时进行能否进行分子索引
我在进行clustsize计算的时候想要按照分子归簇,提供了索引文件,但是却显示这样一句话Using molecules rather than atoms. Not reading index file index.ndx。我的索引文件是按照residue进行分组的。请问按照分子进行归簇的时候索引文件应该如何编写呢?谢谢!



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sobereva    时间: 2018-1-18 16:24
不用提供索引文件
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wx91aaa    时间: 2018-1-19 15:56
sobereva 发表于 2018-1-18 16:24
不用提供索引文件

谢谢sob老师。因为体系中有多种物质,索引我按照原子归簇并且提供了索引文件。可是计算时总有如图错误提示,我把截断从2到5.5都试过了还是没算出来,请问我该如何调整计算参数呢。谢谢! (, 下载次数 Times of downloads: 38)





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