计算化学公社
标题:
pdb文件连接成轨迹
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作者Author:
mol
时间:
2015-3-18 15:39
标题:
pdb文件连接成轨迹
各位,我有段程序,想输出轨迹,目前只会每隔多少步输出个pdb,请问有什么办法把这些pdb连接成类似xtc似的轨迹文件么?
多谢!
作者Author:
sobereva
时间:
2015-3-18 17:57
直接用cat把pdb合并,就构成了多帧的pdb,放到VMD里就可以当轨迹看了。RCSB上NMR测的蛋白质结构的pdb文件一般就是这样多帧的。
作者Author:
mol
时间:
2015-3-19 16:11
sobereva 发表于 2015-3-18 17:57
直接用cat把pdb合并,就构成了多帧的pdb,放到VMD里就可以当轨迹看了。RCSB上NMR测的蛋白质结构的pdb文件一 ...
搜嘎,多谢!
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