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标题: MS软件中过渡态中生成物的距离 [打印本页]

作者
Author: wangxinmin 时间: 2017-12-18 10:13
标题: MS软件中过渡态中生成物的距离
各位老师，请问一下在进行过渡态搜索是设计的生成物会存在两种，如何确定生成两种结构之间的距离？还是随意设定对模拟的结果没什么影响？请老师帮忙解答一下，谢谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2017-12-18 15:31
你是指诸如一个分子裂解成两个分子的反应？要考察两个产物分子之间的距离？质心距离？几何中心距离？最近原子间距离？之后要模拟什么？
确定距离就对产物结构进行优化，然后量一下就完了

作者
Author: wangxinmin 时间: 2017-12-18 16:49
本帖最后由 wangxinmin 于 2017-12-18 16:50 编辑

老师，是一个分子裂解成两个分子，因为反应物和生成物要自己建模，在建立裂解生成的两个分子模型是是否要考虑断键之后两个分子的质心距离，换句话说，就是一个分子断裂是两个原子之间的化学键的断裂，那断裂之后的这两个原子之间的距离是否要考虑？如果随意建立裂解之后两个分子的模型是否会对真是的结果有影响？之后要对反应物和生成物进行过渡态搜索。

作者
Author: sobereva 时间: 2017-12-18 20:56
我从来不用MS找过渡态
对于Gaussian、ORCA等量化程序，基本都是靠提供过渡态初猜来找过渡态的，对于裂解问题，初猜就摆成马上要裂解的结构就完了。找到TS后，跑IRC，对产物端一优化，一下就知道产物复合物是什么结构了

作者
Author: wangxinmin 时间: 2017-12-18 23:45

sobereva 发表于 2017-12-18 20:56
我从来不用MS找过渡态
对于Gaussian、ORCA等量化程序，基本都是靠提供过渡态初猜来找过渡态的，对于裂解问 ...

知道了，谢谢老师

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