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标题: md模拟NVT系综运算问题 [打印本页]

作者
Author: tracyKTV 时间: 2017-11-30 21:16
标题: md模拟NVT系综运算问题
老师同学们好！我想请问一下各位，就是我在完成了NPT系综的运算模拟后，在进行NVT系综的模拟时，打开log文件时总是显示在step0处不动了（有log附件），请问各位知道是什么原因吗？我所用的mdp文件是NPT系综时用的mdp文件，前面运算都正常也能正常生成tpr文件，就是运算生成NVT系综的log文件时好几天没动静，打开out文件出现Wrote pdb files with previous and current coordinates的字样。还请各位有知道是什么原因的老师或同学能够帮我解答一下，谢谢大家了！

作者
Author: sobereva 时间: 2017-12-1 00:39
先换成最新版本，不行再找原因，光看你的描述看不出什么来
如果最新版本也这样，top看看是否还在算，如果mdrun没用-v参数，加上-v再计算，看终端显示什么

作者
Author: tracyKTV 时间: 2017-12-1 09:24

sobereva 发表于 2017-12-1 00:39
先换成最新版本，不行再找原因，光看你的描述看不出什么来
如果最新版本也这样，top看看是否还在算，如果m ...

谢谢sob老师！我尝试一下

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