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标题: GROMACS REST(replica exchange with solute tempering) 计算报错 [打印本页]

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Author: 紫藤竹 时间: 2017-11-23 11:29
标题: GROMACS REST(replica exchange with solute tempering) 计算报错

我现在在做一个蛋白质的REST(replica exchange withsolute tempering)计算重新定义type B grompp时报错

Cannot automatically perturb a torsion withmultiple terms to different

form.

Please specify perturbed parametersmanually for this torsion in your

topology!

使用charmm27力场在ffbonded.itp中dihedraltypes有的相同原子类型的二面角会有不同参数

HS S CT2 CT1 9 0.00 1.00416 1

HS S CT2 CT1 9 0.00 0.6276 2

HS S CT2 CT1 9 0.00 1.12968 3

protein.itp中对于有多种二面角参数是怎么处理

36 43 45 47 9 0.00 6.6944 1

36 43 45 47 9 180.00 10.46 2

我直接在itp的dihedral添加多种参数这种错误消失了，不知道这种方法对不对

或者是这种

36 43 45 47 9 0.00 6.6944 1 180.00 10.46 2

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