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标题: 怎样通过分子模拟的方法得到一个体系的熵 [打印本页]

作者
Author: nxh9681 时间: 2017-11-6 12:29
标题: 怎样通过分子模拟的方法得到一个体系的熵
怎样通过分子模拟的方法得到一个液相体系的熵？是否可以实现？

作者
Author: fhh2626 时间: 2017-11-6 14:03
这个算是自由能计算的前沿问题了

得到一个体系的熵肯定是不行的（也没有意义），只能得到一个过程的熵变，或者两个状态的熵变

现在最准确的方法是在不同温度下算两次PMF，然后用dS=dG/dT来求

作者
Author: qxx 时间: 2017-12-11 10:16
不好意思，我想问下，用高斯09怎么计算熵校正值呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-12-11 14:36

qxx 发表于 2017-12-11 10:16
不好意思，我想问下，用高斯09怎么计算熵校正值呢？

谈谈谐振频率校正因子
http://sobereva.com/221
这和此帖主题完全不相关

作者
Author: qxx 时间: 2017-12-13 15:33

sobereva 发表于 2017-12-11 14:36
谈谈谐振频率校正因子
http://sobereva.com/221
这和此帖主题完全不相关

谢谢老师，不好意思sob老师，下次不会了

作者
Author: astrozheng 时间: 2017-12-15 17:19
倒是有方法可以估算 Conformational entropy，使用Normal Mode Analysis的方法来计算，但是是基于系统能量势垒是Harmonic的假设。

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