sobereva 发表于 2017-9-27 21:56
1 相对于整个图最低点的自由能差。
诸如某结构(3,5)投影在x是3,投影在y是5,只不过这里x,y轴是PC而已
2 ...
霜晨月 发表于 2017-9-28 14:38
分子动力学模拟的体系的维度非常高,N个原子的话,就是3N维;为了简化,对这个3N维空间进行PCA,找出贡献最 ...
霜晨月 发表于 2017-9-28 14:38
分子动力学模拟的体系的维度非常高,N个原子的话,就是3N维;为了简化,对这个3N维空间进行PCA,找出贡献最 ...
alystone 发表于 2017-9-29 09:35
再问个问题,请问怎么看PC1的贡献。谢谢
sobereva 发表于 2017-9-29 12:11
我的博文里已经说了,就是看对应的eigenvalues.xvg里的值
alystone 发表于 2017-9-29 13:22
谢谢sob老师,可能是我表达的不清楚。我想直观看一下的是哪些二级结构和PC1的运动是有关系的。
alystone 发表于 2017-9-29 13:22
谢谢sob老师,可能是我表达的不清楚。我想直观看一下的是哪些二级结构和PC1的运动是有关系的。
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