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标题: AMBER如何计算粘度 [打印本页]

作者
Author: alystone 时间: 2017-8-21 19:02
标题: AMBER如何计算粘度
如题，请问amber如何计算体系的粘度。

作者
Author: sobereva 时间: 2017-8-21 21:07
可以跑完MD后自己写程序用Green-Kubo公式来算，公式参见如
Molecular Simulation, Vol. 33, No. 15, December 2007, 1261–1266
JCP, 116, 209
可能网上也有现成的脚本能处理

作者
Author: alystone 时间: 2017-8-22 09:02

sobereva 发表于 2017-8-21 21:07
可以跑完MD后自己写程序用Green-Kubo公式来算，公式参见如
Molecular Simulation, Vol. 33, No. 15, Decem ...

谢谢sob老师。

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