计算化学公社

标题: 含固体体系蛋白粗粒化力场求推 [打印本页]

作者
Author: Gratitude_zy 时间: 2017-5-26 08:44
标题: 含固体体系蛋白粗粒化力场求推
需要实现的目标如下：想要得到不同蛋白质在固体材料面表面的相互作用力来表征结合强度，材料拟选取 TiO2，蛋白分子力较大（如：溶菌酶蛋白），试过 Martini 力场，效果不好，有其他比较合适一点的CG模型推荐吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-5-26 15:44
基本也没什么更合适的
建议还是用全原子或者联合原子力场，否则CG折腾一通，最终结果不好，还不如一开始就用全原子，都已经跑完了
而且CG模型和固体表面的相互作用势可靠性也值得怀疑，而且与表面作用的原子级别的细节也都没了，不好更深层次讨论

作者
Author: Gratitude_zy 时间: 2017-5-27 15:08

sobereva 发表于 2017-5-26 15:44
基本也没什么更合适的
建议还是用全原子或者联合原子力场，否则CG折腾一通，最终结果不好，还不如一开始就 ...

好的，其实早已经有转向全原子的打算，只是想看看CG最后还有没有希望。谢谢社长

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