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标题: amber跑动力学时H原子跑开了 [打印本页]

作者
Author: kjxwl3 时间: 2017-4-27 22:32
标题: amber跑动力学时H原子跑开了
各位amber大神：
我在用amber做动力学时，乙醇作为非水溶剂，采用gaff的力场，bcc的电荷。力场都没有问题，在控制文件中也加了ntc=2,ntf=2，结果乙醇的H会跑开，不知道是为什么？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-4-30 11:09
你先跑个乙醇单体看是否氢也跑开，如果也这样，明显是当前力场有问题，诸如少了相应的成键项

作者
Author: zjuhjx 时间: 2017-5-12 10:00
对，可能就是键的设置就没有

作者
Author: baylor2017 时间: 2017-6-29 03:33
键的设置就没有

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